Quando editamos pelo Gedit é muito comum vermos alguns arquivos com o sufixo “~” na mesma pasta. Isto acontece porque a opção “criar uma cópia de backup dos arquivos antes de salvar” esta habilitado dentro do menu Preferências, do Gedit.
Desabilite esta opção e deixe marcado a opção “salvar arquivos automaticamente a cada (5) minutos”.
Fim! Comente.